Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX1P22670 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX1P22670 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX1P22670 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX1P22670 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX1P22670 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX1P22670 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX1P22670 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX1P22670 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX1P22670 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX1P22670 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX1P22670 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX1P22670 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX1P22670 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX1P22670 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX1P22670 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX1P22670 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX1P22670 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX1P22670 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX1P22670 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX1P22670 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX1P22670 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX1P22670 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX1P22670 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX1P22670 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX1P22670 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX1P22670 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX1P22670 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX1P22670 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX1P22670 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX1P22670 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX1P22670 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX1P22670 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX1P22670 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX1P22670 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX1P22670 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX1P22670 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX1P22670 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX1P22670 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX1P22670 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX1P22670 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX1P22670 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX1P22670 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX1P22670 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX1P22670 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX1P22670 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX1P22670 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX1P22670 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX1P22670 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX1P22670 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX1P22670 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX1P22670 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX1P22670 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX1P22670 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX1P22670 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX1P22670 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX1P22670 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX1P22670 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX1P22670 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX1P22670 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX1P22670 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX1P22670 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX1P22670 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX1P22670 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX1P22670 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX1P22670 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms