Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR3P22607 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms