Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCP2P22307 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCP2P22307 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCP2P22307 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCP2P22307 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCP2P22307 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCP2P22307 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCP2P22307 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCP2P22307 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCP2P22307 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCP2P22307 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCP2P22307 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCP2P22307 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCP2P22307 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCP2P22307 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCP2P22307 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCP2P22307 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCP2P22307 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCP2P22307 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCP2P22307 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCP2P22307 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCP2P22307 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCP2P22307 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCP2P22307 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCP2P22307 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCP2P22307 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCP2P22307 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCP2P22307 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCP2P22307 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCP2P22307 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCP2P22307 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCP2P22307 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCP2P22307 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCP2P22307 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCP2P22307 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCP2P22307 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCP2P22307 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2P22307 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2P22307 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2P22307 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2P22307 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2P22307 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2P22307 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2P22307 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2P22307 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2P22307 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2P22307 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2P22307 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2P22307 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2P22307 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2P22307 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2P22307 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2P22307 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2P22307 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2P22307 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2P22307 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2P22307 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCP2P22307 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCP2P22307 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCP2P22307 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCP2P22307 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCP2P22307 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCP2P22307 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCP2P22307 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCP2P22307 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCP2P22307 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCP2P22307 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCP2P22307 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2P22307 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2P22307 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2P22307 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2P22307 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2P22307 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2P22307 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2P22307 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2P22307 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2P22307 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2P22307 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2P22307 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2P22307 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2P22307 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2P22307 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2P22307 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2P22307 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2P22307 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2P22307 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2P22307 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCP2P22307 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCP2P22307 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCP2P22307 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCP2P22307 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCP2P22307 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCP2P22307 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCP2P22307 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCP2P22307 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCP2P22307 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCP2P22307 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCP2P22307 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCP2P22307 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCP2P22307 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms