Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERBB3P21860 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERBB3P21860 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms