Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MSR1P21757 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSR1P21757 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSR1P21757 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSR1P21757 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSR1P21757 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSR1P21757 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MSR1P21757 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSR1P21757 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSR1P21757 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSR1P21757 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSR1P21757 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSR1P21757 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSR1P21757 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSR1P21757 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSR1P21757 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSR1P21757 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSR1P21757 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSR1P21757 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSR1P21757 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSR1P21757 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSR1P21757 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MSR1P21757 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSR1P21757 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSR1P21757 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSR1P21757 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSR1P21757 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSR1P21757 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSR1P21757 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MSR1P21757 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSR1P21757 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSR1P21757 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSR1P21757 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSR1P21757 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSR1P21757 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSR1P21757 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSR1P21757 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSR1P21757 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSR1P21757 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSR1P21757 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSR1P21757 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSR1P21757 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSR1P21757 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSR1P21757 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSR1P21757 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSR1P21757 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSR1P21757 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSR1P21757 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSR1P21757 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSR1P21757 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSR1P21757 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSR1P21757 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSR1P21757 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSR1P21757 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSR1P21757 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSR1P21757 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSR1P21757 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSR1P21757 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSR1P21757 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSR1P21757 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSR1P21757 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSR1P21757 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSR1P21757 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSR1P21757 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSR1P21757 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSR1P21757 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MSR1P21757 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSR1P21757 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSR1P21757 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSR1P21757 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSR1P21757 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSR1P21757 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSR1P21757 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSR1P21757 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSR1P21757 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSR1P21757 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSR1P21757 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSR1P21757 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSR1P21757 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSR1P21757 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSR1P21757 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSR1P21757 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSR1P21757 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSR1P21757 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSR1P21757 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSR1P21757 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSR1P21757 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSR1P21757 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSR1P21757 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSR1P21757 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MSR1P21757 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MSR1P21757 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSR1P21757 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSR1P21757 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSR1P21757 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSR1P21757 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSR1P21757 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSR1P21757 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSR1P21757 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSR1P21757 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms