Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRAP18433 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
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