Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA1P17302 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA1P17302 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA1P17302 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA1P17302 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA1P17302 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA1P17302 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA1P17302 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA1P17302 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA1P17302 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA1P17302 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA1P17302 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA1P17302 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA1P17302 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA1P17302 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA1P17302 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA1P17302 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA1P17302 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA1P17302 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA1P17302 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA1P17302 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA1P17302 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA1P17302 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA1P17302 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA1P17302 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA1P17302 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA1P17302 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA1P17302 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA1P17302 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA1P17302 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA1P17302 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJA1P17302 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJA1P17302 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJA1P17302 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA1P17302 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA1P17302 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA1P17302 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA1P17302 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA1P17302 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA1P17302 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA1P17302 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA1P17302 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA1P17302 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA1P17302 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA1P17302 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA1P17302 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA1P17302 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA1P17302 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA1P17302 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA1P17302 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA1P17302 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA1P17302 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA1P17302 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA1P17302 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA1P17302 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA1P17302 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA1P17302 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA1P17302 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA1P17302 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA1P17302 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA1P17302 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA1P17302 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA1P17302 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA1P17302 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA1P17302 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA1P17302 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA1P17302 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA1P17302 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA1P17302 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA1P17302 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA1P17302 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA1P17302 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA1P17302 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms