Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB3P16520 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB3P16520 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB3P16520 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB3P16520 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB3P16520 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB3P16520 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB3P16520 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB3P16520 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB3P16520 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB3P16520 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB3P16520 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB3P16520 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB3P16520 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB3P16520 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GNB3P16520 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB3P16520 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB3P16520 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB3P16520 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB3P16520 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB3P16520 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB3P16520 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB3P16520 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB3P16520 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB3P16520 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB3P16520 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB3P16520 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB3P16520 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB3P16520 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB3P16520 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB3P16520 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB3P16520 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB3P16520 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB3P16520 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB3P16520 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNB3P16520 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB3P16520 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB3P16520 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB3P16520 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB3P16520 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB3P16520 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB3P16520 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB3P16520 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB3P16520 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB3P16520 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB3P16520 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB3P16520 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB3P16520 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB3P16520 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB3P16520 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB3P16520 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB3P16520 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB3P16520 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB3P16520 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB3P16520 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB3P16520 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNB3P16520 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB3P16520 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB3P16520 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB3P16520 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB3P16520 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB3P16520 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB3P16520 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB3P16520 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB3P16520 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB3P16520 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB3P16520 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB3P16520 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB3P16520 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB3P16520 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB3P16520 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB3P16520 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB3P16520 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB3P16520 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB3P16520 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB3P16520 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNB3P16520 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GNB3P16520 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GNB3P16520 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GNB3P16520 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GNB3P16520 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GNB3P16520 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB3P16520 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB3P16520 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB3P16520 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB3P16520 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB3P16520 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB3P16520 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB3P16520 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB3P16520 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB3P16520 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB3P16520 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB3P16520 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB3P16520 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB3P16520 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNB3P16520 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB3P16520 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms