Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGB4P16144 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB4P16144 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms