Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPB41P11171 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPB41P11171 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPB41P11171 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPB41P11171 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPB41P11171 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EPB41P11171 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPB41P11171 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPB41P11171 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPB41P11171 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPB41P11171 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPB41P11171 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPB41P11171 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPB41P11171 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPB41P11171 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPB41P11171 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPB41P11171 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPB41P11171 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPB41P11171 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPB41P11171 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
EPB41P11171 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPB41P11171 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPB41P11171 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EPB41P11171 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPB41P11171 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPB41P11171 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EPB41P11171 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPB41P11171 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EPB41P11171 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPB41P11171 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPB41P11171 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPB41P11171 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPB41P11171 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPB41P11171 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPB41P11171 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPB41P11171 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPB41P11171 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPB41P11171 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPB41P11171 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPB41P11171 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPB41P11171 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPB41P11171 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPB41P11171 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPB41P11171 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPB41P11171 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPB41P11171 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPB41P11171 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EPB41P11171 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EPB41P11171 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPB41P11171 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB41P11171 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB41P11171 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB41P11171 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB41P11171 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB41P11171 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB41P11171 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB41P11171 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB41P11171 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB41P11171 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB41P11171 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB41P11171 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB41P11171 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB41P11171 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB41P11171 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB41P11171 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPB41P11171 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB41P11171 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB41P11171 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB41P11171 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB41P11171 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB41P11171 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB41P11171 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB41P11171 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB41P11171 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB41P11171 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB41P11171 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB41P11171 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41P11171 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41P11171 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41P11171 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41P11171 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41P11171 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41P11171 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41P11171 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41P11171 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41P11171 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41P11171 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41P11171 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41P11171 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41P11171 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41P11171 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPB41P11171 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPB41P11171 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPB41P11171 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPB41P11171 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPB41P11171 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPB41P11171 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPB41P11171 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPB41P11171 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPB41P11171 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms