Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GLI4P10075 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GLI4P10075 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GLI4P10075 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GLI4P10075 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GLI4P10075 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GLI4P10075 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GLI4P10075 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GLI4P10075 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GLI4P10075 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GLI4P10075 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GLI4P10075 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GLI4P10075 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GLI4P10075 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GLI4P10075 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GLI4P10075 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GLI4P10075 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GLI4P10075 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GLI4P10075 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GLI4P10075 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GLI4P10075 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GLI4P10075 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GLI4P10075 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GLI4P10075 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GLI4P10075 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI4P10075 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI4P10075 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI4P10075 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI4P10075 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI4P10075 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI4P10075 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI4P10075 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI4P10075 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI4P10075 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI4P10075 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI4P10075 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI4P10075 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI4P10075 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI4P10075 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI4P10075 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI4P10075 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI4P10075 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI4P10075 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GLI4P10075 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GLI4P10075 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GLI4P10075 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI4P10075 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GLI4P10075 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms