Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGKV1-13P0DP09 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-13P0DP09 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms