Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms