Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2BP0DI82 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2BP0DI82 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms