Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M4

RHOXF2B, Rhox homeobox family member 2B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2BP0C7M4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOXF2BP0C7M4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOXF2BP0C7M4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms