Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC175P0C221 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC175P0C221 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms