Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C4BP0C0L5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C4BP0C0L5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
C4BP0C0L5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C4BP0C0L5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C4BP0C0L5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C4BP0C0L5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C4BP0C0L5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
C4BP0C0L5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms