Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXB7P09629 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms