Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTAP09496 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTAP09496 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTAP09496 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTAP09496 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTAP09496 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTAP09496 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTAP09496 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTAP09496 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTAP09496 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTAP09496 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTAP09496 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTAP09496 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTAP09496 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTAP09496 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTAP09496 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTAP09496 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTAP09496 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTAP09496 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTAP09496 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTAP09496 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTAP09496 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTAP09496 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTAP09496 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTAP09496 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTAP09496 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTAP09496 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTAP09496 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTAP09496 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTAP09496 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTAP09496 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTAP09496 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTAP09496 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTAP09496 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTAP09496 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTAP09496 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTAP09496 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTAP09496 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTAP09496 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTAP09496 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTAP09496 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTAP09496 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLTAP09496 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLTAP09496 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLTAP09496 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLTAP09496 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLTAP09496 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTAP09496 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTAP09496 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTAP09496 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTAP09496 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTAP09496 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTAP09496 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTAP09496 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTAP09496 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTAP09496 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTAP09496 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTAP09496 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTAP09496 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTAP09496 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTAP09496 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTAP09496 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTAP09496 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTAP09496 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTAP09496 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTAP09496 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTAP09496 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTAP09496 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTAP09496 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTAP09496 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTAP09496 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTAP09496 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTAP09496 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTAP09496 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTAP09496 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTAP09496 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTAP09496 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTAP09496 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTAP09496 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTAP09496 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTAP09496 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTAP09496 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTAP09496 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTAP09496 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTAP09496 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTAP09496 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTAP09496 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTAP09496 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTAP09496 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTAP09496 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTAP09496 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTAP09496 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTAP09496 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms