Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSF1RP07333 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms