Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCCAP05165 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCCAP05165 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCCAP05165 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCCAP05165 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCCAP05165 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCCAP05165 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PCCAP05165 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCCAP05165 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCCAP05165 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCCAP05165 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PCCAP05165 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCCAP05165 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PCCAP05165 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCCAP05165 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCCAP05165 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCCAP05165 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCCAP05165 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCCAP05165 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCCAP05165 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCCAP05165 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCCAP05165 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCCAP05165 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCCAP05165 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCCAP05165 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCCAP05165 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCCAP05165 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCCAP05165 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCCAP05165 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCCAP05165 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCCAP05165 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCCAP05165 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCCAP05165 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCCAP05165 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCCAP05165 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCCAP05165 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCCAP05165 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCCAP05165 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCCAP05165 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCCAP05165 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PCCAP05165 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCCAP05165 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCCAP05165 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCCAP05165 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCCAP05165 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCCAP05165 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCCAP05165 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCCAP05165 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCCAP05165 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCCAP05165 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCCAP05165 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCCAP05165 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCCAP05165 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PCCAP05165 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCCAP05165 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCCAP05165 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCCAP05165 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCCAP05165 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCCAP05165 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCCAP05165 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCCAP05165 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCCAP05165 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCCAP05165 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCCAP05165 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCCAP05165 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCCAP05165 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCCAP05165 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCCAP05165 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCCAP05165 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCCAP05165 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCCAP05165 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCCAP05165 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCCAP05165 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCCAP05165 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCCAP05165 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCCAP05165 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCCAP05165 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PCCAP05165 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCCAP05165 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCCAP05165 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCCAP05165 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCCAP05165 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCCAP05165 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCCAP05165 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCCAP05165 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCCAP05165 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCCAP05165 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCCAP05165 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCCAP05165 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCCAP05165 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCCAP05165 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCCAP05165 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCCAP05165 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PCCAP05165 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCCAP05165 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCCAP05165 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCCAP05165 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCCAP05165 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCCAP05165 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCCAP05165 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms