Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTNP04004 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTNP04004 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTNP04004 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTNP04004 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTNP04004 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTNP04004 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTNP04004 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTNP04004 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTNP04004 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTNP04004 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTNP04004 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTNP04004 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTNP04004 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VTNP04004 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VTNP04004 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTNP04004 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTNP04004 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTNP04004 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTNP04004 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VTNP04004 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTNP04004 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTNP04004 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTNP04004 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTNP04004 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTNP04004 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTNP04004 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTNP04004 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTNP04004 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTNP04004 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTNP04004 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTNP04004 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTNP04004 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTNP04004 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTNP04004 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTNP04004 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VTNP04004 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTNP04004 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTNP04004 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTNP04004 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTNP04004 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTNP04004 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTNP04004 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTNP04004 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VTNP04004 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VTNP04004 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VTNP04004 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTNP04004 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTNP04004 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTNP04004 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTNP04004 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTNP04004 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTNP04004 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTNP04004 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTNP04004 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTNP04004 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VTNP04004 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTNP04004 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VTNP04004 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTNP04004 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTNP04004 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTNP04004 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTNP04004 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTNP04004 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTNP04004 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTNP04004 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTNP04004 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTNP04004 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTNP04004 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTNP04004 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VTNP04004 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTNP04004 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VTNP04004 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VTNP04004 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTNP04004 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTNP04004 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTNP04004 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTNP04004 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTNP04004 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTNP04004 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTNP04004 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTNP04004 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTNP04004 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VTNP04004 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTNP04004 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTNP04004 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTNP04004 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTNP04004 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTNP04004 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTNP04004 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTNP04004 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTNP04004 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTNP04004 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTNP04004 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTNP04004 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTNP04004 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTNP04004 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTNP04004 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTNP04004 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTNP04004 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms