Protein–RNA interactions for Protein: P01602

IGKV1-5, Immunoglobulin kappa variable 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-5P01602 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV1-5P01602 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV1-5P01602 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms