Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
APBA3O96018 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APBA3O96018 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APBA3O96018 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APBA3O96018 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APBA3O96018 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APBA3O96018 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APBA3O96018 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APBA3O96018 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
APBA3O96018 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APBA3O96018 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APBA3O96018 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APBA3O96018 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APBA3O96018 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APBA3O96018 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APBA3O96018 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APBA3O96018 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APBA3O96018 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APBA3O96018 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APBA3O96018 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APBA3O96018 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APBA3O96018 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APBA3O96018 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
APBA3O96018 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APBA3O96018 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
APBA3O96018 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APBA3O96018 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
APBA3O96018 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APBA3O96018 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APBA3O96018 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APBA3O96018 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APBA3O96018 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APBA3O96018 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APBA3O96018 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APBA3O96018 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APBA3O96018 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APBA3O96018 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APBA3O96018 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APBA3O96018 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
APBA3O96018 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
APBA3O96018 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
APBA3O96018 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
APBA3O96018 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APBA3O96018 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
APBA3O96018 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APBA3O96018 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APBA3O96018 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APBA3O96018 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APBA3O96018 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APBA3O96018 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APBA3O96018 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APBA3O96018 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APBA3O96018 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APBA3O96018 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APBA3O96018 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APBA3O96018 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
APBA3O96018 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APBA3O96018 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APBA3O96018 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APBA3O96018 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APBA3O96018 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APBA3O96018 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APBA3O96018 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APBA3O96018 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APBA3O96018 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APBA3O96018 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APBA3O96018 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APBA3O96018 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APBA3O96018 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APBA3O96018 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
APBA3O96018 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APBA3O96018 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APBA3O96018 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APBA3O96018 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APBA3O96018 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APBA3O96018 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APBA3O96018 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APBA3O96018 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
APBA3O96018 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APBA3O96018 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APBA3O96018 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APBA3O96018 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APBA3O96018 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APBA3O96018 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APBA3O96018 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APBA3O96018 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APBA3O96018 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APBA3O96018 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APBA3O96018 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
APBA3O96018 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APBA3O96018 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APBA3O96018 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APBA3O96018 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
APBA3O96018 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APBA3O96018 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APBA3O96018 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APBA3O96018 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
APBA3O96018 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APBA3O96018 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APBA3O96018 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms