Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX58O95786 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX58O95786 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX58O95786 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX58O95786 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX58O95786 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX58O95786 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX58O95786 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX58O95786 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX58O95786 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX58O95786 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX58O95786 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX58O95786 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX58O95786 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX58O95786 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX58O95786 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX58O95786 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX58O95786 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX58O95786 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX58O95786 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX58O95786 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX58O95786 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX58O95786 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX58O95786 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX58O95786 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX58O95786 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX58O95786 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX58O95786 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX58O95786 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX58O95786 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX58O95786 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX58O95786 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX58O95786 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX58O95786 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX58O95786 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX58O95786 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX58O95786 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX58O95786 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX58O95786 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX58O95786 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX58O95786 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX58O95786 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX58O95786 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX58O95786 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX58O95786 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX58O95786 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX58O95786 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX58O95786 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX58O95786 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX58O95786 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX58O95786 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX58O95786 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX58O95786 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX58O95786 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX58O95786 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX58O95786 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
DDX58O95786 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
DDX58O95786 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX58O95786 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX58O95786 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX58O95786 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX58O95786 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX58O95786 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX58O95786 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX58O95786 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX58O95786 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX58O95786 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX58O95786 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX58O95786 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX58O95786 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX58O95786 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX58O95786 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX58O95786 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX58O95786 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX58O95786 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX58O95786 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX58O95786 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX58O95786 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX58O95786 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX58O95786 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX58O95786 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX58O95786 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX58O95786 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX58O95786 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX58O95786 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX58O95786 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX58O95786 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX58O95786 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX58O95786 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX58O95786 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX58O95786 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX58O95786 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX58O95786 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX58O95786 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX58O95786 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX58O95786 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX58O95786 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX58O95786 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX58O95786 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX58O95786 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms