Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG12O94817 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG12O94817 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG12O94817 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG12O94817 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG12O94817 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG12O94817 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG12O94817 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG12O94817 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG12O94817 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG12O94817 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG12O94817 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG12O94817 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG12O94817 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG12O94817 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG12O94817 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG12O94817 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG12O94817 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG12O94817 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG12O94817 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG12O94817 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG12O94817 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG12O94817 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG12O94817 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG12O94817 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG12O94817 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG12O94817 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG12O94817 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG12O94817 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG12O94817 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG12O94817 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG12O94817 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG12O94817 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG12O94817 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG12O94817 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG12O94817 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG12O94817 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG12O94817 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG12O94817 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATG12O94817 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG12O94817 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG12O94817 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG12O94817 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG12O94817 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG12O94817 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG12O94817 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG12O94817 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG12O94817 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG12O94817 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG12O94817 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG12O94817 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG12O94817 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG12O94817 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG12O94817 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG12O94817 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG12O94817 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG12O94817 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATG12O94817 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATG12O94817 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATG12O94817 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG12O94817 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG12O94817 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG12O94817 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG12O94817 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG12O94817 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG12O94817 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG12O94817 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG12O94817 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG12O94817 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG12O94817 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG12O94817 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG12O94817 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms