Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBOX1O75936 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms