Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCATO75600 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GCATO75600 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCATO75600 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCATO75600 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCATO75600 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCATO75600 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCATO75600 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCATO75600 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCATO75600 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCATO75600 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCATO75600 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCATO75600 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCATO75600 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GCATO75600 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCATO75600 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCATO75600 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCATO75600 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCATO75600 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCATO75600 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCATO75600 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCATO75600 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCATO75600 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCATO75600 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCATO75600 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCATO75600 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCATO75600 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCATO75600 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GCATO75600 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCATO75600 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCATO75600 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCATO75600 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCATO75600 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCATO75600 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCATO75600 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCATO75600 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCATO75600 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCATO75600 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCATO75600 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCATO75600 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCATO75600 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCATO75600 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCATO75600 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GCATO75600 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCATO75600 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCATO75600 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCATO75600 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCATO75600 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCATO75600 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCATO75600 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCATO75600 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCATO75600 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCATO75600 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCATO75600 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCATO75600 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCATO75600 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCATO75600 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCATO75600 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCATO75600 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCATO75600 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCATO75600 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCATO75600 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCATO75600 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCATO75600 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCATO75600 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCATO75600 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCATO75600 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCATO75600 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCATO75600 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GCATO75600 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCATO75600 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCATO75600 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCATO75600 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCATO75600 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCATO75600 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms