Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
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CLDN11O75508 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN11O75508 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN11O75508 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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