Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN5O75503 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN5O75503 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN5O75503 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN5O75503 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN5O75503 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN5O75503 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLN5O75503 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN5O75503 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN5O75503 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN5O75503 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLN5O75503 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN5O75503 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLN5O75503 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN5O75503 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN5O75503 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN5O75503 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN5O75503 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN5O75503 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN5O75503 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN5O75503 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN5O75503 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN5O75503 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN5O75503 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN5O75503 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN5O75503 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN5O75503 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN5O75503 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN5O75503 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN5O75503 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN5O75503 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN5O75503 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN5O75503 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN5O75503 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN5O75503 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN5O75503 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN5O75503 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN5O75503 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN5O75503 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN5O75503 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN5O75503 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN5O75503 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN5O75503 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN5O75503 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN5O75503 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN5O75503 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN5O75503 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN5O75503 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN5O75503 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN5O75503 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN5O75503 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN5O75503 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN5O75503 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN5O75503 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN5O75503 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN5O75503 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN5O75503 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN5O75503 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN5O75503 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN5O75503 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN5O75503 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN5O75503 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN5O75503 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN5O75503 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN5O75503 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN5O75503 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN5O75503 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN5O75503 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN5O75503 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLN5O75503 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLN5O75503 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLN5O75503 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN5O75503 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms