Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LGR5O75473 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGR5O75473 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LGR5O75473 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGR5O75473 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGR5O75473 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGR5O75473 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LGR5O75473 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LGR5O75473 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGR5O75473 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGR5O75473 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGR5O75473 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGR5O75473 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LGR5O75473 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGR5O75473 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGR5O75473 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGR5O75473 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGR5O75473 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGR5O75473 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LGR5O75473 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR5O75473 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR5O75473 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR5O75473 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR5O75473 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR5O75473 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR5O75473 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR5O75473 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR5O75473 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LGR5O75473 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR5O75473 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR5O75473 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR5O75473 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR5O75473 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR5O75473 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR5O75473 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR5O75473 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR5O75473 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR5O75473 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR5O75473 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR5O75473 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR5O75473 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR5O75473 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR5O75473 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR5O75473 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR5O75473 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR5O75473 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR5O75473 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR5O75473 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR5O75473 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LGR5O75473 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR5O75473 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR5O75473 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR5O75473 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR5O75473 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR5O75473 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR5O75473 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR5O75473 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR5O75473 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR5O75473 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR5O75473 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR5O75473 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR5O75473 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LGR5O75473 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR5O75473 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR5O75473 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR5O75473 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR5O75473 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR5O75473 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR5O75473 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR5O75473 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR5O75473 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR5O75473 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR5O75473 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR5O75473 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR5O75473 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR5O75473 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR5O75473 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR5O75473 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR5O75473 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR5O75473 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR5O75473 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR5O75473 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR5O75473 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGR5O75473 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR5O75473 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR5O75473 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR5O75473 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR5O75473 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR5O75473 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR5O75473 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR5O75473 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR5O75473 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR5O75473 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR5O75473 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR5O75473 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR5O75473 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGR5O75473 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR5O75473 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR5O75473 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGR5O75473 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms