Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPFIA3O75145 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPFIA3O75145 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA3O75145 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms