Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMFO60524 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMFO60524 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMFO60524 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMFO60524 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMFO60524 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMFO60524 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMFO60524 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMFO60524 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEMFO60524 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEMFO60524 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEMFO60524 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEMFO60524 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NEMFO60524 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEMFO60524 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEMFO60524 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEMFO60524 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEMFO60524 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEMFO60524 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEMFO60524 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMFO60524 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMFO60524 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMFO60524 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMFO60524 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMFO60524 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMFO60524 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMFO60524 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMFO60524 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMFO60524 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMFO60524 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMFO60524 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMFO60524 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMFO60524 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMFO60524 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMFO60524 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMFO60524 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMFO60524 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMFO60524 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMFO60524 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMFO60524 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMFO60524 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEMFO60524 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEMFO60524 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEMFO60524 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEMFO60524 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEMFO60524 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEMFO60524 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEMFO60524 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEMFO60524 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEMFO60524 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEMFO60524 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NEMFO60524 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEMFO60524 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEMFO60524 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEMFO60524 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEMFO60524 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEMFO60524 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEMFO60524 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEMFO60524 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEMFO60524 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEMFO60524 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEMFO60524 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEMFO60524 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEMFO60524 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEMFO60524 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NEMFO60524 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEMFO60524 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEMFO60524 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEMFO60524 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEMFO60524 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEMFO60524 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEMFO60524 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEMFO60524 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEMFO60524 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms