Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX16O60231 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX16O60231 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX16O60231 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX16O60231 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX16O60231 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX16O60231 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX16O60231 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX16O60231 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX16O60231 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX16O60231 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX16O60231 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX16O60231 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX16O60231 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX16O60231 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX16O60231 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX16O60231 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX16O60231 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX16O60231 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX16O60231 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX16O60231 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX16O60231 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX16O60231 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX16O60231 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX16O60231 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX16O60231 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX16O60231 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX16O60231 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX16O60231 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX16O60231 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX16O60231 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX16O60231 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX16O60231 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX16O60231 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX16O60231 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX16O60231 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX16O60231 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX16O60231 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX16O60231 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX16O60231 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX16O60231 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX16O60231 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX16O60231 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX16O60231 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX16O60231 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX16O60231 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX16O60231 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX16O60231 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX16O60231 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX16O60231 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX16O60231 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX16O60231 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX16O60231 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DHX16O60231 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DHX16O60231 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DHX16O60231 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DHX16O60231 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DHX16O60231 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DHX16O60231 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DHX16O60231 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DHX16O60231 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DHX16O60231 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DHX16O60231 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DHX16O60231 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DHX16O60231 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DHX16O60231 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DHX16O60231 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DHX16O60231 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DHX16O60231 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DHX16O60231 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DHX16O60231 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DHX16O60231 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DHX16O60231 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX16O60231 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX16O60231 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX16O60231 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX16O60231 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX16O60231 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX16O60231 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX16O60231 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX16O60231 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX16O60231 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX16O60231 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX16O60231 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX16O60231 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX16O60231 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX16O60231 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX16O60231 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX16O60231 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX16O60231 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX16O60231 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX16O60231 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX16O60231 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX16O60231 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DHX16O60231 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHX16O60231 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHX16O60231 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHX16O60231 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHX16O60231 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DHX16O60231 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms