Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP9O43818 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP9O43818 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP9O43818 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP9O43818 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP9O43818 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP9O43818 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP9O43818 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP9O43818 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP9O43818 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP9O43818 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP9O43818 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP9O43818 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP9O43818 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP9O43818 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP9O43818 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP9O43818 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP9O43818 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP9O43818 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP9O43818 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP9O43818 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP9O43818 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP9O43818 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP9O43818 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP9O43818 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP9O43818 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP9O43818 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP9O43818 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP9O43818 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP9O43818 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP9O43818 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP9O43818 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP9O43818 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP9O43818 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP9O43818 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP9O43818 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP9O43818 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP9O43818 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP9O43818 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP9O43818 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP9O43818 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP9O43818 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP9O43818 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP9O43818 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP9O43818 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP9O43818 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP9O43818 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP9O43818 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP9O43818 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP9O43818 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP9O43818 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP9O43818 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP9O43818 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP9O43818 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP9O43818 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP9O43818 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP9O43818 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP9O43818 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP9O43818 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP9O43818 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP9O43818 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP9O43818 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP9O43818 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP9O43818 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP9O43818 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP9O43818 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP9O43818 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP9O43818 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP9O43818 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP9O43818 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP9O43818 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP9O43818 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP9O43818 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP9O43818 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP9O43818 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP9O43818 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP9O43818 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP9O43818 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP9O43818 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP9O43818 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP9O43818 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP9O43818 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP9O43818 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP9O43818 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP9O43818 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP9O43818 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP9O43818 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP9O43818 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP9O43818 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP9O43818 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP9O43818 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP9O43818 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP9O43818 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP9O43818 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP9O43818 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP9O43818 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP9O43818 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP9O43818 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP9O43818 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP9O43818 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms