Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms