Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms