Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms