Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXC11O43248 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms