Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FANCAO15360 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FANCAO15360 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FANCAO15360 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FANCAO15360 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FANCAO15360 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
FANCAO15360 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FANCAO15360 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FANCAO15360 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FANCAO15360 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FANCAO15360 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FANCAO15360 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FANCAO15360 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FANCAO15360 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FANCAO15360 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FANCAO15360 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FANCAO15360 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FANCAO15360 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
FANCAO15360 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FANCAO15360 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FANCAO15360 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FANCAO15360 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FANCAO15360 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FANCAO15360 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FANCAO15360 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FANCAO15360 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
FANCAO15360 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FANCAO15360 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FANCAO15360 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FANCAO15360 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FANCAO15360 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FANCAO15360 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
FANCAO15360 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FANCAO15360 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FANCAO15360 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FANCAO15360 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FANCAO15360 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FANCAO15360 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FANCAO15360 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FANCAO15360 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
FANCAO15360 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FANCAO15360 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FANCAO15360 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FANCAO15360 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FANCAO15360 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FANCAO15360 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
FANCAO15360 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FANCAO15360 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FANCAO15360 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FANCAO15360 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FANCAO15360 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FANCAO15360 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FANCAO15360 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FANCAO15360 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FANCAO15360 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FANCAO15360 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FANCAO15360 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FANCAO15360 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FANCAO15360 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FANCAO15360 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FANCAO15360 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FANCAO15360 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FANCAO15360 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FANCAO15360 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
FANCAO15360 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
FANCAO15360 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
FANCAO15360 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FANCAO15360 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
FANCAO15360 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
FANCAO15360 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
FANCAO15360 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
FANCAO15360 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FANCAO15360 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FANCAO15360 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FANCAO15360 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FANCAO15360 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FANCAO15360 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FANCAO15360 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FANCAO15360 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
FANCAO15360 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC32■■■□□ 2.71
FANCAO15360 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
FANCAO15360 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FANCAO15360 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FANCAO15360 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FANCAO15360 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FANCAO15360 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
FANCAO15360 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
FANCAO15360 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
FANCAO15360 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
FANCAO15360 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FANCAO15360 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
FANCAO15360 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
FANCAO15360 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
FANCAO15360 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
FANCAO15360 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FANCAO15360 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FANCAO15360 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FANCAO15360 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FANCAO15360 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
FANCAO15360 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms