Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHADO15335 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHADO15335 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHADO15335 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHADO15335 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHADO15335 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHADO15335 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHADO15335 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHADO15335 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHADO15335 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHADO15335 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHADO15335 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHADO15335 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHADO15335 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHADO15335 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHADO15335 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHADO15335 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHADO15335 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHADO15335 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHADO15335 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHADO15335 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHADO15335 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHADO15335 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHADO15335 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHADO15335 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHADO15335 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHADO15335 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHADO15335 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHADO15335 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHADO15335 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHADO15335 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHADO15335 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHADO15335 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHADO15335 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHADO15335 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHADO15335 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHADO15335 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHADO15335 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHADO15335 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHADO15335 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHADO15335 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHADO15335 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHADO15335 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHADO15335 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHADO15335 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHADO15335 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHADO15335 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHADO15335 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHADO15335 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHADO15335 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHADO15335 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHADO15335 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHADO15335 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHADO15335 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHADO15335 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHADO15335 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHADO15335 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHADO15335 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHADO15335 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHADO15335 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHADO15335 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHADO15335 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHADO15335 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHADO15335 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHADO15335 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHADO15335 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHADO15335 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHADO15335 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHADO15335 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHADO15335 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHADO15335 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHADO15335 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHADO15335 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHADO15335 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHADO15335 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHADO15335 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHADO15335 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHADO15335 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHADO15335 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHADO15335 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHADO15335 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHADO15335 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHADO15335 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHADO15335 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHADO15335 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHADO15335 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHADO15335 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHADO15335 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHADO15335 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHADO15335 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHADO15335 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHADO15335 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHADO15335 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHADO15335 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHADO15335 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHADO15335 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHADO15335 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHADO15335 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHADO15335 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHADO15335 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms