Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYNMO15061 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYNMO15061 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYNMO15061 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYNMO15061 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYNMO15061 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYNMO15061 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYNMO15061 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYNMO15061 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYNMO15061 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYNMO15061 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYNMO15061 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYNMO15061 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYNMO15061 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYNMO15061 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SYNMO15061 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SYNMO15061 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYNMO15061 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYNMO15061 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYNMO15061 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SYNMO15061 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYNMO15061 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYNMO15061 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYNMO15061 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYNMO15061 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SYNMO15061 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYNMO15061 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SYNMO15061 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYNMO15061 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYNMO15061 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYNMO15061 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYNMO15061 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYNMO15061 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYNMO15061 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SYNMO15061 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYNMO15061 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYNMO15061 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYNMO15061 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYNMO15061 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYNMO15061 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYNMO15061 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYNMO15061 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYNMO15061 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYNMO15061 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYNMO15061 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYNMO15061 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYNMO15061 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SYNMO15061 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYNMO15061 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYNMO15061 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYNMO15061 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYNMO15061 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYNMO15061 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYNMO15061 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYNMO15061 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYNMO15061 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYNMO15061 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SYNMO15061 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYNMO15061 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYNMO15061 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYNMO15061 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYNMO15061 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYNMO15061 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYNMO15061 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYNMO15061 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYNMO15061 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SYNMO15061 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYNMO15061 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SYNMO15061 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYNMO15061 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYNMO15061 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYNMO15061 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYNMO15061 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SYNMO15061 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SYNMO15061 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SYNMO15061 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SYNMO15061 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SYNMO15061 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SYNMO15061 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SYNMO15061 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SYNMO15061 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SYNMO15061 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SYNMO15061 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SYNMO15061 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SYNMO15061 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SYNMO15061 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SYNMO15061 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SYNMO15061 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SYNMO15061 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SYNMO15061 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYNMO15061 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYNMO15061 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYNMO15061 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYNMO15061 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYNMO15061 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYNMO15061 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYNMO15061 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYNMO15061 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYNMO15061 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYNMO15061 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms