Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM6BO15054 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
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