Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PHOX2AO14813 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2AO14813 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms