Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD8O14715 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms