Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARVCFO00192 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms