Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms