Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms