Protein–RNA interactions for Protein: H3BQ06

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQ06 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BQ06 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BQ06 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQ06 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQ06 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQ06 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQ06 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQ06 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQ06 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQ06 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQ06 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQ06 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQ06 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQ06 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQ06 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQ06 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BQ06 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQ06 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQ06 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQ06 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQ06 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQ06 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQ06 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQ06 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQ06 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQ06 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BQ06 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQ06 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQ06 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQ06 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQ06 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQ06 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQ06 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQ06 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQ06 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BQ06 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
H3BQ06 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQ06 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQ06 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQ06 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQ06 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQ06 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQ06 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQ06 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQ06 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQ06 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQ06 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQ06 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQ06 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQ06 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQ06 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQ06 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQ06 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQ06 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BQ06 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQ06 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQ06 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQ06 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQ06 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQ06 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQ06 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQ06 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22■■□□□ 1.11
H3BQ06 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQ06 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQ06 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQ06 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQ06 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQ06 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22■■□□□ 1.11
H3BQ06 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22■■□□□ 1.11
H3BQ06 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BQ06 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQ06 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQ06 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQ06 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQ06 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQ06 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQ06 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQ06 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQ06 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQ06 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQ06 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQ06 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQ06 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQ06 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQ06 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQ06 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQ06 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQ06 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQ06 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BQ06 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQ06 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQ06 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQ06 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQ06 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQ06 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQ06 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQ06 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQ06 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQ06 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BQ06 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms