Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA8SH3BPF8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms